Pokémon JCC Online solo está disponible para los sistema operativos Windows y MacOS por ahora, pero existe una forma de poder jugarlo en Ubuntu 16.04 (Y seguramente en otras distribuciones Linux), para poder instalarlo solo necesitarás tener Wine y el instalador de Pokémon JCC de Windows, el instalador lo puedes descargar desde la página oficial de Pokémon.
Primero instalas Wine, tienes que utilizar estos comandos en el terminal para instalarlo:
sudo add-apt-repository ppa:wine/wine-builds (Con esto añades el repositorio)
sudo apt-get update (Actualiza)
sudo apt-get install --install-recommends winehq-staging (Descarga e instala Wine)
Ahora ya tienes Wine instalado y puedes ejecutar el instalador de Windows, una vez ejecutado comenzará la instalación igual que en Windows, pulsas siguiente en todos los pasos y en el ultimo paso de la instalación preguntará si quieres abrir el juego, es importarte marcar No y finalizar. Una vez terminada la instalación tendrás un acceso directo en el escritorio y ya podrás jugar a Pokémon JCC Online.